 |  | Table des matièresIntroduction : Modèles, simulations, systèmes (Franck Varenne, Marc Silberstein, Jean-Jacques Kupiec, Guillaume Lecointre)
Partie 1.1 : Epistémologie des modèles et des simulations
La conception sémantique des théories scientifiques. II : comment peut-elle rester «sémantique» ? (Soazig Le Bihan, philosophe, Illinois Institute of Technology, Chicago)
Turing, entre le formel de Hilbert et la forme de Goethe (Jean Lassègue, philosophe, CREA)
Simulations numériques et expérimentation (Anouk Barberousse, philosophe, IHPST, Sara Franceschelli, philosophe, ENSLSH, Lyon & Cyrille Imbert, philosophe, université de Caen)
Que peut expliquer un modèle complexe et peut-on le comprendre ? (Pierre-Alain Braillard, philosophe, IHPST)
Biologie des systèmes et recherche des lois générales (Evelyn Fox Keller, philosophe, MIT, EU)
Des sciences exactes aux phénomènes du vivant, à partir de Schrödinger : mathématiques, programme et modèles (Giuseppe Longo, mathématicien, ENS)
Modèles et simulations : pluriformaliser, simuler, remathématiser (Franck Varenne, philosophe, université de Rouen)
Partie 1.2 : Pratiques et usages des modèles et des simulations
Les modèles de l’économie cognitive (Bernard Walliser, économiste, Ponts et Chaussées)
Sur le rôle de la théorie en biologie. Un exemple de théorie biologique intégrative : la MTIP (Gilbert Chauvet, biophysicien, EPHE)
Une petite histoire de la modélisation du métabolisme cellulaire. Vers une théorie du métabolisme en biologie (Jean-Pierre Mazat, biochimiste, Inserm, Bordeaux)
Principes de la biologie des systèmes et leurs applications en modélisation (Denis Noble, physiologiste, université d'Oxford)
Modélisation moléculaire individu-centrée : contribution à une biologie des systèmes (Olivier Gandrillon, biologiste moléculaire, université Lyon 1)
Partie 2 : Hommage
Un hommage à Jean-Paul Gouteux : la randonnée d’un biologiste au pays des mathématiques (Marc Jarry, biologiste, université de Pau & Marc Artzrouni, mathématicien, université de Pau)
Partie 3 : Varia
Sur le statut épistémologique de la linguistique et la nature de son objet (David Piotrowski, linguiste, CREA-CNRS)
Partie 4 : Impostures intellectuelles
Quand la futurologie rencontre le grand public : permanence et constance d’une vulgate. Lectures croisées de Jacques Attali et de Joël de Rosnay (David Forest, avocat)
Index des noms
Les contributeurs
 Modèles, simulations, systèmes. Ce triptyque, réunissant des outils de connaissance, des moyens de connaître (les modèles, les simulations), et des objets extrêmement présents en biologie (les systèmes), a pour ambition de présenter quelques réflexions emblématiques des débats en cours sur ces questions, ainsi que des études de cas, principalement dans le domaine de la biologie. La simultanéité d’un regard sur les modèles-simulations et sur les systèmes nous permet de constater un fait épistémologique majeur : la montée en puissance du réalisme des modèles-simulations ainsi que l’essor d’une nouvelle biologie des systèmes, biologie réclamant d’importants moyens de calcul et des outils conceptuels à la hauteur du déferlement de données expérimentales qui caractérise, notamment, cette approche de la biologie. Les interrogations cruciales que suscite cette dernière, par exemple quant à l’existence et à la mise en évidence de principes généraux du vivant ou de lois du vivant, sont également explorées ici.
Les auteurs de ce dossier thématique sont : Anouk Barberousse, philosophe, IHPST, Paris ; Gilbert Chauvet, biophysicien, EPHE, Paris ; Sarah Franceschelli, philosophe, ENSLS-H, Lyon ; Olivier Gandrillon, biologiste moléculaire, université Lyon 1 ; Cyrille Imbert, philosophe, université de Caen ; Evelyn Fox Keller, philosophe, MIT, USA ; Jean Lassègue, philosophe, CREA, Paris ; Soazig Le Bihan, philosophe, Illinois Institute of Technology, Chicago ; Giuseppe Longo, mathématicien, ENS, Paris ; Jean-Pierre Mazat, biochimiste, INSERM, Bordeaux ; Denis Noble, physiologiste, université d’Oxford ; Franck Varenne, historien des sciences, philosophe, université de Rouen et CNRS ; Bernard Walliser, économiste, Ponts-et-Chaussées, Paris. Ce dossier se clôt par l’hommage rendu par Marc Jarry (biologiste, université de Pau) et Marc Artzrouni (mathématicien, université de Pau) au biologiste modélisateur Jean-Paul Gouteux, mort en 2006.
Dans sa partie « Varia », cet ouvrage présente un long article de David Piotrowski (linguiste, CREA, CNRS, Paris) sur le statut épistémologique de la linguistique et la nature de son objet. La partie « Impostures intellectuelles » donne la parole au politologue David Forest, qui rend compte de la litanie des légèretés de nos médiatiques futurologues.
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