Table des matières
1 DE L'ANTIQUITÉ À DARWIN
1-1 Préhistoire et prescience de l'espèce
1-2 Aristote
1-2-1 Le fondateur de la biologie
1-2-2 L'espèce naturelle
1-2-3 L'espèce, "universel du savoir"
1-2-4 La dérive essentialiste
1-3 Vingt siècles sans biologie
1-4 L'emboîtement des germes
1-5 La crise de 1700
1-5-1 John Ray : la première définition biologique de l'espèce
1-5-2 Locke : la première critique en règle
1-5-3 Leibniz : la première défense
1-6 L'avènement des grands taxonomistes
1-6-1 Linné : la nomenclature
1-6-2 Buffon : le premier fondement biologique de l’espèce
1-6-3 Adanson : l'art et la méthode de classer des ressemblances
1-7 Lamarck
1-7-1 Le systématicien
1-7-2 L'évolutionniste
1-7-3 L'émergence naturelle de la série ascendante des êtres
1-7-4 L'effet de l'environnement
1-7-5 L'hérédité de l'acquis
1-7-6 L'espèce est la rencontre de la série et de l'environnement
1-7-7 L'isolement reproductif et la relation entre conjoints
1-7-8 "Tel milieu, telle espèce"
1-8 L'espèce au xixe siècle
1-8-1 Cuvier : l'espèce est un concept majeur des sciences naturelles
1-8-2 Quelques précurseurs de l'espèce écologique
1-9 Darwin
1-9-1 La variation et la continuité adaptatives
1-9-2 De la race à l'espèce
1-9-3 Le modèle sélectif
1-10 L'espèce au plus bas
2 BIOMÉTRIE ET GÉNÉTIQUE
Les débuts
2-1 Le désarroi au tournant du siècle
2-2 La biométrie : l'espèce est une mesure
2-3 La génétique : l'espèce est une mutation
2-3-1 La génétique est mal préparée à affronter l'espèce
2-3-2 De Vries
2-3-3 L'espèce est un caryotype
2-3-4 Autour de Morgan
2-4 L'espèce est le protoplasme ou l'idioplasme
2-5 Les accommodats, les écotypes
2-6 Le point de vue des naturalistes
2-6-1 Réconcilier l'évolutionnisme avec l'espèce
2-6-2 Le partage de la variation
2-7 La pensée populationniste
2-8 Les premières définitions modernes
3 PERMANENCE DES QUESTIONS
3-1 La transgression de l'ordre ancien
3-2 L'apparition de l'ordre nouveau
3-3 La Grande Chaîne des Êtres
3-4 Le labyrinthe du continu
3-5 Essence et type
3-6 Le constructivisme
3-7 L'espèce est-elle un concept scientifique ?
4 DIVERSITÉ DES RÉPONSES
Définitions d'auteurs
4-1 Définitions
4-2 Discussion
4-3 Trois relations
5 RESSEMBLANCE
5-1 Deux individus qui se ressemblent appartiennent à une même espèce
5-2 Les caractères
5-2-1 L'habitus
5-2-2 L'anatomie
5-2-3 Les genitalia
5-2-4 Le caryotype
5-2-5 La chimiotaxonomie
5-3 Les distances
5-3-1 Généralités
5-3-2 La taxonomie numérique
5-3-3 L'espèce est une distance type
5-4 L'art de la différence
5-4-1 La différence est-elle un critère d'espèce ?
5-4-2 Le caractère ou la différence diagnostique
5-4-3 Les clefs de détermination
5-4-4 La relation d'altérité
5-4-5 L'espèce nouvelle
5-4-6 La pulvérisation des espèces
5-5 Pas assez ou trop de ressemblance
5-5-1 Le polymorphisme
5-5-2 Le polytypisme
5-5-3 Les espèces jumelles
5-5-4 Le mimétisme
5-5-5 Le dimorphisme sexuel, la polyphasie, les cycles et alternances
5-6 L'espèce n'est pas seulement une ressemblance
6 DESCENDANCE
6-1 Deux individus qui descendent l'un de l'autre appartiennent à une même espèce
6-2 Gradualisme phylétique ou équilibres ponctués
6-2-1 L'évolution est graduelle et chaque espèce une séquence arbitraire
6-2-2 L'évolution procède par sauts, et chaque stase est une espèce
6-2-3 Exemples de gradualisme et de sauts
6-2-4 La corne d'abondance
6-2-5 La maille stratigraphique
6-3 La dichotomie indéfinie
6-3-1 La duplication-modification
6-3-2 L'emboîtement
6-3-3 L'espèce ancestrale est une abstraction
6-3-4 L'espèce internodale
6-3-5 Les taxons terminaux, lignées monophylétiques ultimes
6-3-6 Le rang taxonomique "espèce"
6-3-7 L'espèce n'est toujours pas définie
6-4 La convergence
6-4-1 Coalescence et cohésion moléculaire
6-4-2 La congruence adaptative
6-4-3 La réticulation sexuelle
6-4-4 Le cladisme géographique, l'isolement par les circonstances
6-4-5 L'espèce par descendance est une classe de convergence
6-5 L'espèce en paléontologie
6-5-1 Le fossile marqueur
6-5-2 La chronospecies
6-5-3 L'espèce évolutive
6-5-4 Les trends
6-5-5 Une classe de ressemblance durable
7 INTERFÉCONDITÉ
Le film des événements
7-1 La relation réciproque
7-1-1 Des difficultés inattendues
7-1-2 Relation pré- et postzygotique
7-1-3 Mesure de l'isolement reproductif
7-1-4 La communauté reproductive
7-2 La rencontre dans l'habitat et la niche spécifique
7-3 La cour sexuelle : la relation vécue
7-3-1 Le signal réciproque
7-3-2 L'appel des promis
7-3-3 La cour privée
7-3-4 Répulsion entre espèces affines
7-3-5 Déterminisme génétique de la cour
7-3-6 Les dialectes régionaux
7-3-7 Signaux des hybrides
7-3-8 Seuil et fenêtre de réponse.
7-3-9 L'empreinte
7-3-10 La correspondance émetteur / récepteur
7-3-11 Conclusions
7-4 Les genitalia
7-4-1 La clef et la serrure
7-4-2 Genitalia et isolement
7-5 La fécondation
7-5-1 Fécondation externe
7-5-2 Fécondation interne
7-6 La première génération
7-6-1 Gènes d'isolement postzygotique
7-6-2 Dysgénésie et stérilité d'origine cytoplasmique
7-6-3 Incompatibilité chromosomique
7-6-4 L'isolement chromosomique chez Mus
7-6-5 L'effet Haldane
7-6-6 L'incompatibilité fœto-maternelle
7-7 La fécondité indéfinie
7-8 L'interfécondité chez les végétaux
7-9 La relation d'interfécondité a-t-elle évolué ?
8 INTERFÉCONDITÉ
L'espèce biologique
8-1 Deux individus interféconds appartiennent à une même espèce
8-2 L'espèce biologique
8-3 Le "champ des recombinaisons"
8-4 La reconnaissance des partenaires
8-5 L'isolement sexuel naissant
8-5-1 l'effet Royer-Wallace
8-5-2 Définition de la sélection sexuelle
8-6 Le renforcement
8-6-1 Caractères principaux
8-6-2 Exemples et contre-exemples
8-6-3 Renforcements expérimentaux
8-6-4 Simulations et aspects théoriques
8-7 Le runaway
8-7-1 Définition du runaway
8-7-2 Le recrutement sexuel spécifique
8-7-3 Exemples possibles de runaway
8-8 Rapports aux autres critères
9 INTERFÉCONDITÉ
Du jordanon au syngaméon
9-1 L'interfécondité en défaut
9-2 Taxons uniparentaux chez les animaux
9-3 L'hybridation
9-4 Taxons hybrides chez les animaux
9-5 Trop ou pas assez de sexe chez les plantes supérieures
9-6 Polyploïdie et espèce
9-6-1 Son importance
9-6-2 Autoploïdie
9-6-3 Amphiploïdie
9-7 La réticulation des basses espèces
9-7-1 Hybrides rares et bien identifiés
9-7-2 Les complexes hybrides
9-7-3 Le syngaméon
9-7-4 Conflit entre descendance et fécondation
9-7-5 Espèce primaire, espèce secondaire, espèce tertiaire
9-8 La numériclature des complexes d'espèces
10 L'INTENTION ÉCOLOGIQUE
10-1 La philosophie spontanée du naturaliste et la biologie spontanée du philosophe
10-2 L'adaptation collective aux conditions du milieu
10-2-1 Le milieu est-il un indicateur de l'espèce ?
10-2-2 Cultures et élevages
10-2-3 La maille écologique
10-2-4 La basse espèce locale
10-2-5 Chevauchement des niches : spécialiste ou généraliste
10-2-6 Les espèces vicariantes
10-2-7 Le déplacement adaptatif
10-2-8 La guilde
10-2-9 L'espèce est un régime sélectif commun
10-2-10 L'espèce cohésive
10-2-11 L'espèce éthologique
10-2-12 L'espèce édaphique
10-2-13 L'espace-temps de cohabitation : la population
10-3 L'espèce recrute les prédateurs spécialisés
10-3-1 Le recrutement
10-3-2 La spécificité concertée du dîneur et du dîner
10-4 La spécificité hôte-parasite et l'espèce "au second degré"
10-4-1 Une terminologie équivoque
10-4-2 Quelques exemples
10-4-3 Séquelles adaptatives
10-4-4 La cospéciation hôte-parasite
10-4-5 Le spécialiste strict est une exception
10-5 La spécificité symbiotique
10-5-1 La loi d'association
10-5-2 Quelques exemples
10-6 L'espèce chez les lichens
10-7 Il n'est rien dans l'espèce qui ne vienne du milieu, si ce n'est l'espèce elle-même
11 MICROBIOLOGIE
11-1 "Un germe - une maladie - un vaccin"
11-2 Prémices
11-3 Le critère de ressemblance
11-3-1 Aspect des colonies et des bactéries
11-3-2 La taxonomie numérique et la taxospecies
11-3-3 La biochimie de l'ADN et l'espèce génomique
11-4 Le difficile compromis avec l'espèce vernaculaire
11-5 La parasexualité
11-5-1 Le brassage génétique dans les populations bactériennes
11-5-2 Les relations parasexuelles
11-5-3 Les systèmes de reconnaissance
11-5-4 L'espèce parabiologique
11-6 L'espèce chez les virus
11-6-1 Définitions de l'espèce virale
11-6-2 Les recombinaisons génétiques
11-6-3 L'espèce polythétique
11-6-4 La quasispecies des rétrovirus
11-6-5 Existe-t-il des espèces de virus ?
12 NOMENCLATURE ET VOCABULAIRE
12-1 Le contexte historique et culturel
12-2 L'espèce dans la nomenclature zoologique
12-2-1 Le binom latin
12-2-2 La règle de priorité
12-2-3 Les types nomenclaturaux
12-2-4 Les animaux domestiques
12-3 L'espèce dans la nomenclature botanique
12-3-1 Le code de Tokyo
12-3-2 Les orchidées
12-3-3 Les champignons
12-4 Les parataxons
12-4-1 Les ichnotaxons
12-4-2 Les conodontes
12-4-3 Le pollen et les spores
12-5 L'espèce dans la nomenclature des bactéries
12-6 L'espèce dans la nomenclature des virus
12-7 L'espèce dans la nomenclature des minéraux
12-8 Espèce nominale et espèce naturelle
12-8-1 De la nature de l'espèce à l'inventaire des espèces
12-8-2 Archétype, prototype et type porte-nom
12-8-3 Le nom fait-il l'espèce ?
12-8-4 Le biocode universel
12-9 Le vocabulaire de l'espèce
13 PLURALISME DE L'ESPÈCE
13-1 L'inaccessible synthèse
13-2 La sous-espèce
13-2-1 Définition
13-2-2 Caractères de la sous-espèce
13-2-3 La race
13-2-4 Sous-espèce géographique ou basse espèce locale ?
13-2-5 Sous-espèce chronologique, écologique, microbienne
13-2-6 Le va-et-vient taxonomique
13-3 Les taxons flous
13-4 L'unité selon les groupes
13-5 La non-espèce
13-6 Les principaux concepts
13-7 L'entr’expression des concepts
13-8 L'ultime entité réelle
13-9 Les relations kantiennes
14 COHÉSION DE L’ESPÈCE
14-1 Régime sélectif et descendance
14-2 Flux génique
14-3 Modularité de l'espèce
14-4 Défauts de cohésion : l'isolement
14-4-1 Géographique
14-4-2 Ecologique
14-4-3 Prézygotique
14-4-4 Postzygotique
14-4-5 Ontogénie et phylogénie de l'isolement
14-5 L’organisation de l'espèce
14-6 Défauts de cohésion : l'hybridation
14-6-1 Les zones d'hybridation
14-6-2 Opportunisme adaptatif
14-6-3 Génétique des zones de tension
14-6-4 Formation de sous-ensembles distincts et cohésifs
15 VIE DES ESPÈCES
15-1 Nombre d'espèces
15-2 Durée de vie d'une espèce
15-2-1 La paléontologie
15-2-2 La biochimie
15-3 Jeunesse, maturité et déclin de l’espèce
15-4 L'espèce est un individu
15-5 Sélection des espèces
15-5-1 L'espèce est une unité de sélection
15-5-2 Orthospéciation ou orthosélection des espèces ?
15-5-3 Les hiérarchies biologiques
15-5-4 Les unités évolutivement significatives
15-6 Foules et essaims d'espèces
15-6-1 Des lignées prolifiques
15-6-2 Spéciation, spécialisation, spéciabilité
16 ORDRE ET ESPÈCE
16-1 Les représentations de l'espèce
16-2 Homéomères
16-3 Fractales
16-4 L'espèce est un chemin de percolation
16-5 Catastrophes
16-6 L'ordre visible
16-6-1 L'espèce est compliquée et complexe
16-6-2 L'espèce ou le chaos
16-7 La réciprocité
16-7-1 La codification symbolique
16-7-2 La conspiration pour l'égalité
16-8 Théorie des jeux
16-9 Information
16-9-1 Les niveaux d'information
16-9-2 La cohésion par contraintes relationnelles
16-9-3 La spéciation par remontée d'instructions
16-9-4 L'espèce est un attracteur
16-9-5 L'espèce est un programme et les espèces des données
16-10 Le réseau-mémoire
16-10-1 Le réseau immunitaire
16-10-2 L'image interne et le moi de la lignée
16-10-3 La commémoration
17 FINALITÉ ET BEAUTÉ DE L'ESPÈCE
17-1 La finalité organique
17-2 Rationalisme, téléonomie, cybernétique
17-3 Temps linéaire, temps cyclique
17-4 L'espèce romantique
17-5 Mythologie des espèces
17-6 Droit et commerce
17-7 Intelligence et beauté de l'espèce
CONCLUSION
BIBLIOGRAPHIE
INDEX DES ORGANISMES
INDEX DES SUJETS
